21 грудня, 2019
Профиль альвеолярной микробиоты у пациентов с ТБ легких и ИП
У пациентов с различными заболеваниями легких было продемонстрировано наличие легочной микробиоты человека, главным образом в образцах мокроты. Однако для изучения альвеолярной микробиоты образец бронхоальвеолярного лаважа (БАЛ) представлен средой нижних дыхательных путей (НДП). В настоящее время не известно, существует ли специфический профиль альвеолярной микробиоты при заболеваниях легких человека, таких как туберкулез (ТБ) и интерстициальная пневмония (ИП).
Методы. Образцы БАЛ 6 пациентов с активной формой ТБ, 6 пациентов с ИП и 10 здоровых добровольцев были использованы для выделения ДНК с последующей амплификацией полного бактериального гена 16S рибосомальной РНК (16S рДНК). 16S рДНК секвенировали с помощью настольного секвенсора MiSeq, данные анализировали с помощью программного обеспечения QIIME для определения таксономической группы.
Результаты. Альвеолярная микробиота у больных ТБ, пациентов с ИП и здоровых добровольцев характеризовалась 6 доминирующими типами: Firmicutes, Proteobacteria, Bacteroidetes, Actinobacteria, Fusobacteria и Cyanobacteria. Значительное снижение представителей отдела Firmicutes наблюдалось у пациентов с ИП. У пациентов с ТБ и ИП альвеолярная микробиота характеризовалась значительным снижением численности рода Streptococcus, отмечалось увеличение численности микобактерий у больных ТБ и уменьшение распространенности Acinetobacter у пациентов с ИП по сравнению с соответствующими показателями у здоровых добровольцев. При этом между пациентами с ТБ и участниками с ИП наблюдалось важное различие: у первых количество Fusobacterium было значительно ниже. Единичные роды, которые были менее многочисленными у пациентов, чем у здоровых добровольцев, были охарактеризованы для каждой исследуемой группы.
Выводы. Это исследование показывает, что профиль альвеолярной микробиоты в образцах БАЛ больных с ТБ и ИП, представляющих инфекционные и неинфекционные заболевания легких соответственно, характеризуется меньшим разнообразием.
Vázquez-Pérez J.A. et al. Alveolar microbiota profile in patients with human pulmonary tuberculosis and interstitial pneumonia. Microb Pathog. 2019.
Медична газета «Здоров’я України 21 сторіччя» № 22 (467), листопад 2019 р.